Ok. Dans le fichier default, la 2e partie est curieuse. Il semblerait que ce soit certbot qui ai créé un server_name tdem.rubujeto.eu. Peut être que tout n’a pas été fait dans le bon ordre, et que le fichier peertube n’existait pas (ou n’était pas enabled) au moment où certbot a été lancé.
Déplacer les lignes avec «managed by certbot» dans le fichier peertube, aux bons endroits, et supprimer le 2e bloc «server { … }» du fichier default devrait remettre les choses en ordre.
Il faudra vérifier au renouvellement du certificat (dans 20 jours), que tout se passe bien. Ou alors jeter un oeil à la conf de certbot (mais je ne connais pas par coeur les fichiers en question).
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